后来，清朝政府大举清剿农民起义军，天地会首领吴凌云壮烈牺牲。
1863年，刘永福已27岁，时吴凌云已牺牲，余部由刘永福和张三率领，转移至广西靖西、那坡一带活动，约一年后刘永福投入黄泽宏部。
1866年，刘永福带领余部200多人同另支起义军首领吴鲲汇合，经过扩充整编，组建一个旗，刘永福被任为旗头。
由于刘永福“胆艺过人，重信爱士”，深得部下爱戴和拥护，不久便成为吴鲲农民军中坐第三把交椅的“三哥头”。刘永福着手操使士兵，整肃纪律，选择人才，统一军令。当时他扎营于归顺州（今靖西）安德圩的北帝庙，看见北帝庙神像旁边的周公像手执着一面绘有“北斗七星”图案，镶有狗牙白边的黑色三角旗，就仿造黑旗作为自己队伍的旗帜。
从此以后，这支队伍就举黑旗作战，称为黑旗军。
1867年秋，清政府派广西提督冯子材调集兵力重点进剿桂西南农民军，拉网扫荡，农民军伤亡惨重，军需银晌难以为继，加上农民军首领在艰难时期意见不一，只得分道扬镳，各自率领所部转移到越南。刘永福举义之日，正值越南多难之秋，内忧外患，国无宁日。
法国侵略者强行侵占了越南的南半部之后，疯狂地发动越南北部进攻，梦想灭亡越南，进而从西南入侵中国，建立一个所谓“伟大的法兰西东方帝国”。
萌总裁微微地一笑：“你想赊欠枪弹款？”
刘永福叹口气，堂堂大汉子，脸涨的通红，道：“是，我广西义军，既无钱，也无粮食。只能赊欠。”
“准备要多少军火？”萌总裁仍旧是淡淡的一笑，并没有轻视刘永福的意思，他自己也就是运气好，否则，如果是在广西，云南，四川，这些偏僻的地区发展的话，也应该跟刘永福一般的窘境。
刘永福搓了搓手，“我手下有两千人，但是一条枪都没有。”
萌总裁觉得好笑，想要两千枝就直说呗，拐什么弯子啊？两千枝步枪和子弹，这对于萌总裁来说，不算什么。
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