万历皇帝和崇祯皇帝也基本上是开明皇帝，能接受新思想和推崇新科技。
这些客观条件决定了，明朝再弱，区区满清，综合实力与大明不可同日而语。寒原冰域，百万鞑虏，几十万强悍匪骑，充其量无赖强邻而已。而李自成的百万暴民，本就是打家劫舍的乌合之众，根本没有相提并论的资格。
明朝的灭亡原因，太多人们相信了被满清王朝垄断300年的史册所吹嘘的的八旗“实力”，太多的人们误会了李闯王的贼兵凶悍。却忽略了事情的根本。战胜大明王朝的不是造反农民军，更不是满清，而是天灾，是-----瘟疫！
瘟疫，使，大明王朝，无力回天，再也无法承受。于是，一切是这样开始的———
历朝历代最倒霉的事情，莫过于天灾人祸。我们这个盘古王朝最后的皇帝崇祯爷却都摊上了。上苍不开眼，偏偏在明王朝最危急的时刻里，雪上加霜般再施天威。瘟疫，可怕的瘟疫，无情的降临到大明王朝，降临到当时中国北方百姓的头上。
瘟疫，今天的人们可能不是很熟悉。这是一种急烈性人群传染病，2004年北京“非典”的恐慌程度，如果跟瘟疫相比，“非典”真的九牛一毛，小巫见大巫了。瘟疫是长期与人类相伴的最可怕一种的极烈性传染病。而瘟疫祸国，也绝非个例。
最早文献记载的瘟疫爆发是在2400年前。公元前431年伯罗奔尼撒战争后。死亡极其惨重，就连闻名于世雅典的领袖伯里克利和他的两个儿子也被瘟疫夺取了生命。
公元164，古罗马帝国叙利亚凯旋时，也将瘟疫和战利品一起带回了罗马城；大军所经之处，瘟疫扩散到全国。史称安东尼瘟疫。皇帝马可?奥里略本人感染死去。公元250年再次降临罗马帝国，史称西普里安瘟疫。大约2500万人死于这场恐怖的恶性传染病，是历史上死亡人数最多的之一。
瘟疫是世界性的，当时中国处于东汉时期，据史料记载，瘟疫施虐，民不聊生。黄巾大起义的一个根本因素之一就是当时社会对瘟疫的恐惧。
公元541年，东罗马帝国全境爆发瘟疫。传播极快，先后约有50%以上的居民死去，小山般的尸体堆满了海滩，或者被扔进海里。即使皇帝查士丁尼也没能逃脱瘟疫的侵袭。
十四世纪，全球爆发了瘟疫。黑死病欧洲持续300年，死亡人口30%。在中国，明朝的覆灭，就是这次瘟疫打击的一个结果。
史料记载，明崇祯年间有关鼠类异常活动的记载骤然增加，如《古今图书集成?职方典》卷三八九《开封府部》记载：“夏大疫，人相食，有鼠千百成群渡河而南去。”。
顺治《郾城县志》卷八也有类似的记载：“崇祯十六年有鼠无数，群行田间，几至成公径，甚至与猫共处。”光绪《顺天府志》卷六九的记载称：“崇祯十六年，先是内殿奏章房多鼠盗食，与人相触而不畏。旦后鼠忽屏迹。”
嘉庆《庐州府志》卷四九《祥异》有更明确的记载：“崇祯十四年大疫，郡属旱蝗，群鼠衔尾渡江而北，至无为，数日毙。“
明末鼠类异常活动的现象，结合近代鼠间瘟疫流行过程中鼠类异常活动来看，说明着瘟疫的发生。文献中“毒瘤杀人”、“大头瘟”、“疙瘩瘟”等记载，更加清楚瘟疫的临床症状。起初患者突然发起高烧，有的胡言乱语、行为失控，或者从睡梦中惊醒；然后在腹股沟、腋窝、双腿出现肿胀，一些人长期昏迷或精神错乱。他们的结局多数都是死亡，更为可怕的是，有时候人们正在街上或家中交谈着，一个人突然就开始摇晃，猛然倒在地上死去。人们毫无征兆地成群倒下，无人再去理会....街头、闹市、民居里到处都是倒毙后无人掩埋的尸体，尸体腹部肿胀，眼睛通红，张大的嘴里不断流出脓水。在当时的医疗条件下，全世界医生们回天乏术。
今天的医学研究证实。瘟疫是啮齿科动物或身上的跳蚤携带的病菌引起的，主要是鼠类。一般先在鼠类传播，人畜接触后感染，死亡率高达十之六七，发病到死亡可一天内。瘟疫一般分两种：接触传染的腺瘟疫和呼吸传染的肺瘟疫。
1644年发生能在北京的这场瘟疫，判断为先是腺瘟疫后是肺瘟疫的混合肆虐。1644年是近一万年来最冷的几十年的末期（1580-1644）。回归线南移，我国华北地区地处北纬40。地区，平均气温下降4到6摄氏度，气候寒冷。于是草原植被南移，大量的啮齿动物跟随南下，与原来的农耕大明子民争夺生存空间。对中国人明朝人而言，这是一场惨厉结局的争夺。啮齿动物带来的瘟疫病菌，最终消灭了明朝几百万人口。
更加悲壮的是，这次瘟疫主要发生在中国北方，而这里是中国军事政治文化的中心地域。瘟疫的发生，直接造成了中国北方人口锐减，军队的巨大非战人员损失。预备役兵源的严重不足。
史料记载：北京沦陷前夕，明军守城部队严重匮乏。仅有的一些能上城墙的守军士兵，也是被疾病折磨虚弱不堪。军官，“鞭一人起，一人复卧如故”。尽管北京城是当时世界上最为坚固的军事堡垒，城坚而沟深，但却无奈于可御敌之兵。
这次瘟疫对北京的影响是空前绝后，惨绝人寰的。死鼠尸体污染了战备粮食仓库，也污染了水源，军队和百姓食用后造成瘟疫更大范围扩散；疾病造成的劳动力损失，使紧急战备生产计划化为乌有。瘟疫笼罩下的北京城人人自危，无暇顾它，人心惶惶的京城官民对步步逼近的起义军只能是听之任之。
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